Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Usp49Q6P9L4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Usp49Q6P9L4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Usp49Q6P9L4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Usp49Q6P9L4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms