Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Casc4Q6P2L7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Casc4Q6P2L7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Casc4Q6P2L7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms