Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Paxip1Q6NZQ4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Paxip1Q6NZQ4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Paxip1Q6NZQ4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms