Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Pprc1Q6NZN1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Pprc1Q6NZN1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Pprc1Q6NZN1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Pprc1Q6NZN1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Pprc1Q6NZN1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pprc1Q6NZN1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms