Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec23ipQ6NZC7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sec23ipQ6NZC7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sec23ipQ6NZC7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms