Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXW6

Rad17, Cell cycle checkpoint protein RAD17, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad17Q6NXW6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rad17Q6NXW6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rad17Q6NXW6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rad17Q6NXW6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rad17Q6NXW6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms