Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Szrd1Q6NXN1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Szrd1Q6NXN1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Szrd1Q6NXN1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Szrd1Q6NXN1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 382.5 ms