Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Cpsf6Q6NVF9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Cpsf6Q6NVF9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cpsf6Q6NVF9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Cpsf6Q6NVF9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Cpsf6Q6NVF9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms