Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
2810408A11RikQ6NSU2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
2810408A11RikQ6NSU2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
2810408A11RikQ6NSU2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms