Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ5

Sp140, Sp140 nuclear body protein, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp140Q6NSQ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Sp140Q6NSQ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sp140Q6NSQ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sp140Q6NSQ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sp140Q6NSQ5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms