Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pdcd11Q6NS46 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Pdcd11Q6NS46 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pdcd11Q6NS46 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pdcd11Q6NS46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Pdcd11Q6NS46 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms