Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CltbQ6IRU5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CltbQ6IRU5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CltbQ6IRU5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
CltbQ6IRU5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms