Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hecw2Q6I6G8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw2Q6I6G8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw2Q6I6G8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Hecw2Q6I6G8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms