Protein–RNA interactions for Protein: Q6GV12

Kdsr, 3-ketodihydrosphingosine reductase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdsrQ6GV12 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KdsrQ6GV12 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.32■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KdsrQ6GV12 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KdsrQ6GV12 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms