Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nckap5lQ6GQX2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nckap5lQ6GQX2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Nckap5lQ6GQX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nckap5lQ6GQX2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms