Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Thsd7aQ69ZU6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Thsd7aQ69ZU6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Thsd7aQ69ZU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Thsd7aQ69ZU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Thsd7aQ69ZU6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms