Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zcchc2Q69ZB8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Zcchc2Q69ZB8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Zcchc2Q69ZB8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zcchc2Q69ZB8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms