Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Lrrcc1Q69ZB0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms