Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab3ipQ68EF0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rab3ipQ68EF0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms