Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT5

Tpgs2, Tubulin polyglutamylase complex subunit 2, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs2Q66JT5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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Tpgs2Q66JT5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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Tpgs2Q66JT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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Tpgs2Q66JT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Tpgs2Q66JT5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Tpgs2Q66JT5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tpgs2Q66JT5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Tpgs2Q66JT5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs2Q66JT5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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Tpgs2Q66JT5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Tpgs2Q66JT5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs2Q66JT5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms