Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt12Q64291 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt12Q64291 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt12Q64291 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt12Q64291 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms