Protein–RNA interactions for Protein: Q64104

Nr2e1, Nuclear receptor subfamily 2 group E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e1Q64104 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nr2e1Q64104 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nr2e1Q64104 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nr2e1Q64104 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nr2e1Q64104 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms