Protein–RNA interactions for Protein: Q64028

Phc1, Polyhomeotic-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc1Q64028 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phc1Q64028 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phc1Q64028 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Phc1Q64028 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Phc1Q64028 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms