Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CochQ62507 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CochQ62507 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CochQ62507 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CochQ62507 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CochQ62507 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CochQ62507 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CochQ62507 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CochQ62507 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CochQ62507 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CochQ62507 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CochQ62507 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CochQ62507 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CochQ62507 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CochQ62507 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CochQ62507 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CochQ62507 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CochQ62507 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CochQ62507 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CochQ62507 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CochQ62507 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CochQ62507 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CochQ62507 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CochQ62507 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CochQ62507 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CochQ62507 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CochQ62507 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CochQ62507 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CochQ62507 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CochQ62507 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CochQ62507 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CochQ62507 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CochQ62507 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CochQ62507 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CochQ62507 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CochQ62507 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CochQ62507 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CochQ62507 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CochQ62507 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CochQ62507 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CochQ62507 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CochQ62507 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CochQ62507 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CochQ62507 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CochQ62507 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CochQ62507 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CochQ62507 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CochQ62507 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CochQ62507 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CochQ62507 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CochQ62507 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CochQ62507 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CochQ62507 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CochQ62507 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CochQ62507 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CochQ62507 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CochQ62507 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CochQ62507 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CochQ62507 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CochQ62507 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CochQ62507 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CochQ62507 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms