Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Supt6hQ62383 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Supt6hQ62383 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Supt6hQ62383 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Supt6hQ62383 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Supt6hQ62383 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Supt6hQ62383 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Supt6hQ62383 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Supt6hQ62383 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms