Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Six2Q62232 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six2Q62232 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six2Q62232 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Six2Q62232 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six2Q62232 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six2Q62232 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six2Q62232 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six2Q62232 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Six2Q62232 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms