Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Pabpc2Q62029 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc2Q62029 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc2Q62029 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc2Q62029 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pabpc2Q62029 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
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Pabpc2Q62029 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Pabpc2Q62029 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Pabpc2Q62029 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pabpc2Q62029 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Pabpc2Q62029 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Pabpc2Q62029 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pabpc2Q62029 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pabpc2Q62029 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
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Pabpc2Q62029 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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