Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,53■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC30,52■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,52■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30,51■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC30,51■■■□□ 2,48
Gli3Q61602 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC30,5■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC30,49■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,47■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,46■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC30,45■■■□□ 2,47
Gli3Q61602 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC30,44■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,43■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC30,41■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC30,41■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,39■■■□□ 2,46
Gli3Q61602 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30,37■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30,34■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Gli3Q61602 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Gli3Q61602 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms