Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Dsg1aQ61495 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Dsg1aQ61495 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Dsg1aQ61495 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Dsg1aQ61495 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms