Protein–RNA interactions for Protein: Q61321

Six4, Homeobox protein SIX4, mousemouse

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Length 775 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six4Q61321 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Six4Q61321 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Six4Q61321 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six4Q61321 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Six4Q61321 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six4Q61321 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six4Q61321 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six4Q61321 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Six4Q61321 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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