Protein–RNA interactions for Protein: Q61183

Papola, Poly(A) polymerase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolaQ61183 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PapolaQ61183 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PapolaQ61183 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PapolaQ61183 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms