Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Trpc6Q61143 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trpc6Q61143 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trpc6Q61143 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms