Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Kpna1Q60960 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kpna1Q60960 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kpna1Q60960 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms