Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Grik1Q60934 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Grik1Q60934 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Grik1Q60934 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.4 ms