Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Neurod1Q60867 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Neurod1Q60867 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Neurod1Q60867 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Neurod1Q60867 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms