Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc6a4Q60857 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc6a4Q60857 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc6a4Q60857 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc6a4Q60857 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms