Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atf3Q60765 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Atf3Q60765 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atf3Q60765 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atf3Q60765 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Atf3Q60765 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Atf3Q60765 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Atf3Q60765 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Atf3Q60765 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Atf3Q60765 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Atf3Q60765 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms