Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf4Q60722 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf4Q60722 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tcf4Q60722 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms