Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgaeQ60677 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ItgaeQ60677 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgaeQ60677 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgaeQ60677 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms