Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y4Y6

Gsdma3, Gasdermin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdma3Q5Y4Y6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Gsdma3Q5Y4Y6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Gsdma3Q5Y4Y6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Gsdma3Q5Y4Y6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gsdma3Q5Y4Y6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gsdma3Q5Y4Y6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Gsdma3Q5Y4Y6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Gsdma3Q5Y4Y6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gsdma3Q5Y4Y6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gsdma3Q5Y4Y6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms