Protein–RNA interactions for Protein: Q5XFZ0

UPF0711 protein C18orf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5XFZ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q5XFZ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
Q5XFZ0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q5XFZ0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Q5XFZ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms