Protein–RNA interactions for Protein: Q5U901

Cpa6, Carboxypeptidase A6, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa6Q5U901 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cpa6Q5U901 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cpa6Q5U901 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cpa6Q5U901 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms