Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Brip1Q5SXJ3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Brip1Q5SXJ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Brip1Q5SXJ3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Brip1Q5SXJ3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms