Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUQ9

Ctc1, CST complex subunit CTC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctc1Q5SUQ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctc1Q5SUQ9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctc1Q5SUQ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctc1Q5SUQ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctc1Q5SUQ9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms