Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TefmQ5SSK3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TefmQ5SSK3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TefmQ5SSK3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms