Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQX6

Cyfip2, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyfip2Q5SQX6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cyfip2Q5SQX6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cyfip2Q5SQX6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cyfip2Q5SQX6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms