Protein–RNA interactions for Protein: Q5S248

Tmprss11e, Transmembrane protease serine 11E, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11eQ5S248 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmprss11eQ5S248 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmprss11eQ5S248 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmprss11eQ5S248 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmprss11eQ5S248 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms