Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RilpQ5ND29 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RilpQ5ND29 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RilpQ5ND29 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RilpQ5ND29 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms