Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ttf2Q5NC05 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttf2Q5NC05 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttf2Q5NC05 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms