Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SynaQ5G5D5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SynaQ5G5D5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SynaQ5G5D5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms